база каретки — маловата — лучше чтоб база была не меньше чем ход по оси Z — это примерный рассчет, но при грамотном проектировании все детали будут равнонагруженными.
и люфты будут складываться симметрично.

у меня станок с передвижением по осям 230 на 230 на 65 мм.
http://www.cnczone.ru/forums/index.php?sho…&#entry3383

при усилии на шпинделе порядка 1-го 2-ух кг, он отгибается на приблизительно 0,1-0,3мм там стоят 12мм каленые направляющие и шариковые втулки. с втулками кстати морочился, — когда сверлил — сверло ушло в сторону, пришлось их вручную подгонять, и обмотав по канавке нитью — заливать клеем.

Под ваш вариант не советую брать 10мм направляющие, возьмите хотя бы 12мм .

сверлить можно, но необходимы тиски инструментальные приверченные агрессивно к сверлилке
необходимо затянуть подшипники на самом сверлильном станке чтобы патрон не болтался.
глядеть чтоб не было огромного вылета сверла и патрона.
вставив сверло в патрон — проверить чтоб оно зажалось ровно
сверлить при низких оборотах с неизменной подачей лучше со смазкой.
интенсивно убирать стружку.
необходимо использовать отлично заточенные сверла,

неувязка может появиться из-за несовпадения поперечника просверленного отверстия уводит, б) поперечник выходит чуток больше поперечника сверла, и практически непредсказуемо)

если есть возможность воспользуйтесь разверткой.

как вариант — сделать из пластика следущую конструкцию:

т.е. одну каретку сделать нормально, а вторую — вот так, с винтами и щечкой — она сумеет регулироваться.

а чего не воспользуетесь шариковыми направляющими? — они довольно дешевы, и прощают некорректности.